白滨兼一（关智一 配音）是一个为人和善性格懦弱的内向少年，因为这性格，兼一没少受同学的欺负。为了改变悲惨的现状，兼一决定改头换面重新做人，随即加入了学校的空手道部。没想到，在社团里，兼一的境遇并没有改变，因为被社员讨厌，…

《金田一少年事件簿R第二季》讲述名侦探金田一耕助的孙子金田一一和青梅竹马的好友七濑美雪等人解决一个个疑案的故事。金田一少年事件簿R改编自天树征丸原作，漫画家佐藤文也作画的著名长篇推理漫画「金田一少年事件簿」。

1～4：香港九龙财宝杀人事件 5：速水玲香与不速之客 6～9：炼金术杀人事件 10～14：狱门塾杀人事件 15～16：高空一万米的杀人 17：露营场怪事件 18：跳水池的恶灵 19～22：剑持警部的杀人 23～25：游戏馆杀人事件