《狐门秘事》讲述了在军阀割据时期的鹤灵城，商行少爷肖蓦然（周阶饰）不幸被卷入一起凶杀案，在寻求真相途中结识了实为狐族后裔的护城官白祈（陈奕木饰），查案期间无意中发现了阴阳师晋川（罗翔饰）的阴谋，两人与其殊死搏斗，誓死保卫…

清末民初，战乱不断，邪人王丽娘正害人性命，疯癫江湖术士毛不破与徒弟白祈、白源追捕邪祟来到鹤灵城，白祈将王丽娘及双头蛇击败，王丽娘濒死遗言及标识让毛不破心生疑惑，想起多年灭门惨案。不久，大帅府怪象频生，师徒三人被大帅府邀请…